日本刀以複雜難成的「折返鍛鍊」製造，又可能受到戰鬥的打擊，和經歷過上百年的歷史，所以可能會出現各式各樣的瑕疵。只要不損及實用性和美感，輕微的瑕疵就不會影響刀劍的價值。事實上，有不少的所謂瑕疵，更是某些刀工流派的重要特徵。

刀劍的瑕疵可以分為幾類：

A. 烏口 (Karasunokuchi )在「切先」出現了「刃切」(見 H)，形似烏鴉嘴， 因以為名。

B. 撓 (Shinae)

刀身出現皺紋，代表該處容易被折曲。

C. 脹 (Fukure)

「折返鍛鍊」的時候，因為空氣滲入鋼鐵的疊層中，令疊層的某處不能完整焊合，製成的刀劍內裡就藏著一個氣泡。刀劍經過多次的維修研磨以後，潛藏的氣泡就可能暴露在外，影響觀瞻。

D. 切邊 (Kirikomi)

刀背受損。情況不嚴重的話，對刀劍性能的影響就不大。

E. 埋金 (Umegane)

外嵌的鐵材，即代表該處有瑕疵被故意掩蓋。

F. 割 (Ware)

「折返鍛鍊」的時候，有部份疊層沒有被完全焊合，刀身或者會出現垂直的裂線。若情況不太嚴重，沒有影響刀劍性能的話，這樣的瑕疵還可以接受。事實上，對於擅於製作帶有「"証" 目肌」的刀工流派來說，這個情況根本就不能算是瑕疵。(註："証" 字應以 "木" 部換去 "言" 部。)

G. 棟割 (Muneware)

同「割」，不過在「棟」(刀背) 出現而已。

H. 刃切 (Hagire)

在邊鋒上出現崩裂傷口，而傷口的尖角又與刀身幾成直角，是壞無可壞的情況。既不雅觀，又嚴重影響刀劍的性能。出現這情況的刀劍，只要稍為施力，刀身就可能會折斷。要是傷口的尖角斜向 (超過 45 度)，刀身折斷的機會或可以稍稍減低。若裂口與刀身幾近平行的話就稱為「刃絡」(Hagarami)。

I. 刃毀 (Hakobore)

在刃鋒上的崩裂傷口，底部渾圓，沒有尖角，所以裂痕不會伸廷，刀身亦不會因而折斷。其實，優良的日本刀本來就有防止銳性崩損的特性，能出現「刃毀」的刀劍亦應該有一定的質素。

J. 刃染 (Hajimi)

若鋼材中的碳份不能平均分佈，刀身某部份會顯得特別暗淡無光。研磨技師或可以將暗淡的部份磨去。不過，過份的「研磨」會耗盡刀身的「皮鐵」，若到了「芯鐵」外露的程度，刀劍的價值就會大受影響。

K. "勼" 切 (Nioigire ) (註："勼" 字中的 "九" 字應改為 "匕" 字)

「刃文」出現斷口。經驗老到的研磨師可以用「研磨」的方法將其掩飾。

L. 燒落 (Yakiotoshi)

「刃文」沒有通過「刃區」，這情況或會影響觀感，不過對刀剑的性能卻是正面的 (見 "02 結構圖解" 中 "刃區" 一節)。

M. 水影 (Mizukage)

若刀劍曾被重新淬火，「中心」部份不會被加熱冷卻，所以「刃區」附近會出現一道暗影。

此外，刀劍經過多次的維修研磨，「皮鐵」會受到一定的消耗，刀身表面會變得粗糙，甚至露出「芯鐵」。收藏家稱此情況為「疲」(Tsukare)，而刀劍本身的價值亦會因此而大減。因為刀劍的「中心」部份不會被「研磨」，所以久而久之，「中心」和其他部份的厚度會出現誤差，收藏家可以由此估計刀劍的 "疲倦" 程度。

(註：「芯鐵」外露是「山城國」名刀工「來」派和「備中國」名刀工「青江」的 "特徵"，不是 "瑕疪"。)